المعروف أن نجاح عملية التطعيم يعتمد على عوامل عديدة ويختلف إلى حد كبير فقد تنجح عملية التطعيم عند إجرائها وبنسب عالية وفي بعضها الأخر تكون نسبة نجاح عملية التطعيم منخفضة وغير مشجعة وهناك الكثير من العوامل التي تؤدي إلى فشل أو عدم نجاح إجراء عملية التطعيم ومن أهمها :-
1- عدم التوافق بين الأصل والطعم : لغرض إجراء عملية التطعيم يجب توفر جزئيين نباتين هما الأصل الذي يساهم بالمجموع الجذري والطعم الذي يساهم بالمجموع الخضري ومن أهم علامات فشل إجراء عملية التطعيم هو عدم التوافق الحاصل بين الأصل والطعم والذي ينشأ لأسباب عديدة من أهمها ( كون الأصل والطعم من عائلتين مختلفتين وكون التركيب التشريحي لكل من الأصل والطعم مختلف وكذا التركيب الكيميائي الفسيولوجي لكل منهما مختلف ) وهناك مظاهر يستطيع من خلالها القائم بعملية التطعيم أن يعرف انه لم تكن هناك موافقة بين الأصل والتطعيم بعد إجراء عملية التطعيم منها ( قلة نمو الطعم أو موته من الطرف ووجود انتفاخات عند منطقة الالتحام وحدوث كسر فيها وتكون منطقة الالتحام ملساء ).
2- نوع النبات :- توجد بعض النباتات تمتاز بكون عملية إجراء عملية التطعيم فيها صعبة جدا وتحتاج إلى عناية كبيرة لأجراء عملية التطعيم ولإجراء بعض العمليات الزراعية قبل إجراء عملية التطعيم ( معاملة الطعوم بالأوكسينات ) وذلك لتحسين نسبة نجاح عملية التطعيم ومن أهم هذه النباتات الفستق والكاكي.
3- عدم توفر الظروف البيئية الملائمة لأجراء عملية التطعيم : وجد أن من أهم أسباب فشل إجراء عملية التطعيم هو عدم توفر الظروف البيئية الملائمة من حرارة ورطوبة أثناء وبعد إجراء عملية التطعيم حيث وجد أن انسب درجة حرارة لتكوين نسيج الكالس في منطقة الالتحام بين الأصل والطعم يتراوح بين 21 – 24 م وهذا يفسر بدوره أسباب قلة نجاح عملية التطعيم عند إجرائها في فصل الشتاء ، كما يجب توفر الرطوبة الجوية الملائمة حول منطقة الالتحام حتى لا تجف الطعوم من خلال ربط المنطقة بشمع البارين . لذلك يجب اختيار المواعيد الملائمة لإجراء عملية التطعيم ويكون أثناء سريان العصارة النباتية حتى يمكن فصل القلف عن الخشب بسهولة وفي هذا الصدد فان أفضل موعد لتطعيم الحمضيات مثلا يكون في الربيع في شهري ( آذار ونيسان ) ولتطعيم المانجو من شهر أيار حتى أيلول ولتطعيم الزيتون نيسان حتى تشرين الأول .
4- انخفاض نشاط نمو الأصل : من الضروري لنجاح عملية التطعيم أن يكون الأصل نشطا بدرجة كبيرة لأجل فصل القلف عن الخشب بسهولة لذا قد تفشل عملية التطعيم إذا كان نمو الأصل غير نشط .
5- عدم توفر الخبرة الكافية لإجراء عملية التطعيم : لأجل نجاح عملية التطعيم يجب أن يكون المطعم ملم بخطوات إجراء العملية على أفضل وجه وفي حالة عدم توفر الخبرة الكافية تفشل عملية التطعيم .
6- التلوث بالفيروسات والآفات الحشرية والأمراض : لوحظ أن إصابة منطقة الالتحام بين الأصل والطعم بالفيروسات تؤدي إلى انخفاض نسبة نجاح عملية التطعيم فقد وجد في إكثار الكرز أن نسبة نجاح الطعوم الخالية من الفيروسات كانت 90% في حين بلغت 60% في حالة كون الطعوم مصابة بالفيروسات ، وأحيانا تدخل بعض البكتريا أو الفطريات عن طريق الجروح عند إجراء عملية التطعيم مما يؤدي إلى فشل العملية لذلك يجب مراعاة أن تكون الطعوم خالية من هذه الإصابات كذلك ضرورة تعقيم الأدوات المستخدمة في عملية التطعيم كالسكاكين قبل إجراء العملية .
7- وجود بعض المواد المانعة لنمو الطعوم مثل المواد الصمغية والتانينات لأنها تقلل من نسبة الماء ( جفاف الطعوم ) مما يؤدي إلى قلة نسبة نجاح التطعيم وهذه المواد متواجدتان في المانجو والجوافة .
8- إزالة الأربطة التي تربط الطعوم أو شمع البارين قبل تمام التحام الأصل والطعم يؤدي إلى فشل عملية التطعيم لذا يجب عدم إزالة الأربطة إلا بعد خروج النمو الخضري للطعوم .
